Contenido
- Tipo de archivoArchivo de alineación comprimido
- Binario
- ¿Qué es un archivo CRAM?
- Acerca de los archivos CRAM
Tipo de archivoArchivo de alineación comprimido
¿Qué es un archivo CRAM?
Formato de archivo de alineación comprimido desarrollado por EBI, una estación externa del Laboratorio Europeo de Biología Molecular; almacena las alineaciones de lectura de secuencias de ADN cortas generadas a partir de alineadores de lectura corta como BWA, BBMap y BLAT. Más información
El formato de archivo CRAM es similar al formato de archivo de alineación / mapa binario (BAM), pero presenta una mejor compresión de archivos y un formato de contenedor binario orientado a columnas reestructurado. A medida que los volúmenes de datos aumentan en el campo del software genético, el formato CRAM se diseñó para reducir la huella en el disco de los datos de alineación.
La alineación de lectura corta es el proceso de descifrar de dónde proviene una secuencia en el genoma. Esto puede ser difícil ya que el genoma de referencia es bastante grande y no siempre se buscan coincidencias exactas en el genoma de referencia. Los alineadores de lectura corta se utilizan para buscar secuencias enormes para coincidencias y coincidencias cercanas. Dado que las secuencias son tan grandes, la compresión provista por formatos como CRAM es necesaria para mantener los tamaños de archivo manejables.
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Acerca de los archivos CRAM
Nuestro objetivo es ayudarlo a comprender qué es un archivo con un sufijo * .cram y cómo abrirlo.
El equipo de FileInfo ha investigado y verificado individualmente el tipo de archivo de Alineación comprimida, la descripción del formato de archivo y los programas de Windows enumerados en esta página. Nos esforzamos por lograr el 100% de precisión y solo publicamos información sobre los formatos de archivo que hemos probado y validado.
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